经过招标备案的合同价款低于双方另行签订的协议的合同价款，导致以较低的备案合同作为结算依据的风险，对此应高度重视。
    ①尽量避免在备案的合同之外另行签订协议；②若无法避免，则经过招标备案的合同价款尽可能高于双方另行签订的协议；③仍不能解决风险的，双方签订补充协议时，明确约定经过招标备案的合同价款只是为了办理施工许可证备案之用，对双方没有约束力，最终结算以补充协议为准。